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                允英學術簡報:DNAplus?與AllNGS?初出茅廬 | 高效提取血液游離DNA分子,助力非小細胞肺癌患者液體活檢
                發布時間: 2021-12-20 17:12:56

                    表皮生長因子受體酪氨酸激酶抑制劑(epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitors,EGFR-TKIs)能夠有效提升非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者的生存期與生活質量,但其療效依賴于對患者個體EGFR基因突變的精準鑒定。然而,腫瘤組織樣本并不是總能順利獲取,且組織樣本中存在的腫瘤異質性,導致其不能完全滿足臨床基因檢測需求;但基于血液樣本的液體活檢技術受限于血液中循環腫瘤DNA分子(circulating tumor DNA,ctDNA)的高度片段化與低豐度特點,其檢測靈敏度極為有限。

                    允英醫療聯手上海胸科醫院,入組79名NSCLC患者,并同時收集了患者經福爾馬林固定后石蠟包埋的組織樣本與配對血液樣本,借助高效游離DNA提取的允英DNAplus?技術與高效液相雜交捕獲的允英AllNGS?技術,研究對比了血液樣本與組織樣本中EGFR突變檢測結果的一致性。

                    研究發現,允英DNAplus?與AllNGS?技術的聯合應用,能夠使血液中EGFR突變狀態檢測結果與組織檢測結果的總體一致性達到86.1%(68/79),敏感性達到72.7%(24/33),特異性高達95.7%(44/46)。而部分用藥相關突變如E19del,檢測敏感性達60.0%(12/20),特異性達100%(59/59),一致性達89.9%(71/79);L858R的檢測結果一致性更是高達97.5%(77/79),敏感性和特異性分別為91.7%(11/12)和98.5%(66/67)(圖1)。

                        圖1 聯合技術對血液EGFR檢測結果與組織結果的對比
                    本研究進一步對比了血液與組織樣本中NGS檢測結果,以及組織樣本中突變擴增系統PCR(amplification refractory mutation system,ARMS-PCR)檢測結果,三者的總體一致性也達到78.5%(62/79)(圖2)。


                圖2 不同樣本、不同方法中檢測結果對比

                    依據血漿和組織中的NGS檢測結果,本研究共確定28名患者接受了EGFR TKIs治療。至研究結束,所有患者均顯示部分緩解(partial response,PR)或疾病穩定(stable disease, SD),中位無進展生存期(progress free survival,PFS)為10.8個月(95% CI 9.1-16.8)。

                    綜上,本研究提示應用靶向捕獲測序技術檢測晚期NSCLC患者血漿ctDNA中的EGFR突變的可行性,表明檢測結果與組織檢測結果的相似性。并且,依據ctDNA測序結果確定有EGFR激活突變的28例患者的治療顯示,使用EGFR-TKIs治療可控制疾病進展,具有重要臨床意義。




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